Masalah yang paling penting adalah sifat dan ukuran kista. Pertumbuhan kanker tentu saja berbahaya dan pengobatan segera diperlukan.

Kista non kanker cenderung menyebabkan rasa sakit atau ketidaknyamanan ketika mencapai ukuran tertentu. Jika tumbuh terlalu besar, jaringan ovarium yang tersisa sehat mungkin hancur. Beberapa kista non kanker juga dapat mempengaruhi menstruasi atau berpotensi menganggu kesuburan atau fungsi ovarium sebagai penghasil telur.