Beberapa kista, terutama yang lebih besar, menghasilkan nyeri atau gejala tekan, misalnya pada nyeri tekanan kandung kemih, karena menahan air kencing. Rasa sakit berulang, memburuk selama menstruasi atau kadang-kadang sangat parah dan akut. Yang terakhir terjadi ketika kista pecah atau mengalami torsi. Torsi ovarium adalah keadaan darurat, tidak hanya menyebabkan nyeri yang sangat besar, tetapi  mungkin akan kehilangan  ovarium.

Kista ovarium yang tidak menghasilkan gejala apapun dan hanya dapat terdeteksi oleh beberapa pemeriksaan ginekologi rutin atau pemeriksaan kesehatan. Pemeriksaan USG adalah alat yang paling penting dan berguna untuk mendeteksi kista ovarium.