Bayi yang mempunyai kepala gepeng sejak lahir sering disebakan  oleh tekanan selama dalam kandungan atau trauma pada saat persalinan. Seperti persalinan yang bersiko misalnya kelahiran kurang bulan (premature),  persalinan yang lama, persalinan yang  sulit, penggunaan alat bantu saat persalinan seperti forseps atau vakum, serta posisi kepala yang tidak tepat  waktu persalinan.

Namun, faktor yang paling mempengaruhi bentuk kepala adalah setelah bayi lahir. Beberapa bayi bersiko mempunyai kepala gepeng. Yaitu bayi yang mempunyai leher agak kaku sejak lahir, tidur terlentang terus tanpa diberi waktu untuk tengkurap, dan kepala yang selalu menoleh ke satu sisi.

Selain itu, anak yang mengalami keterlambatan perkembangan motorik dengan badan yang lemas juga mempunyai risiko lebih besar untuk mempunyai kepala yang gepeng.