Tidak seperti pada anak yang lebih tua atau pada dewasa, sepsis yang terjadi pada neonatus dan bayi muda memiliki beberapa gejala jelas. Biasanya, bayi-bayi ini tiba-tiba merasa tidak enak atau “tampak tidak sehat” oleh pengasuhnya. Gejala-gejala dini sepsis atau infeksi dapat bervariasi dari satu anak ke anak lain. Sebagian bayi menunjukkan gejala yang sangat sedikit atau bahkan tidak sama sekali sebelum akhirnya mereka benar-benar sakit.

Beberapa tanda atau gejala umum sepsis pada neonatus atau bayi muda, antara lain:
• Apatis atau kesulitan makan
• Demam atau kadang-kadang temperatur tubuh yang rendah dan tidak stabil
• Rewel
• Letargi
• Tonus menurun
• Perubahan dalam detak nadi – baik lebih cepat dari pada normal (sepsis dini) atau lebih lambat dari biasanya (sepsis lanjut, biasanya juga terjadi syok)
• Bernafas sngat cepat atau kesulitan bernafas
• Periode dimana bayi tampak berhenti bernafas lebih dari 10 detik (apnea)
• Jaundice